Aktuelles

Aktuelle Daten der Hamburg Surveillance Plattform

Hier finden Sie aktuelle Daten zur Verbreitung von SARS-CoV-2-Varianten in Hamburg, erfasst durch die Hamburg-Surveillance Plattform:

28.03.2023: Update der Hamburg Surveillance-Plattform HHSurv zur Verbreitung von SARS-CoV-2-Varianten in Hamburg

PDF Download des Berichts vom 28.03.2023

Aufgrund der Vielfalt derzeit zirkulierender Omikron-Unterlinien und der infolgedessen begrenzten Aussagekraft von PCR-Typisierungen führen wir seit Kalenderwoche 6 (KW6 2023) keine vorläufige PCR Testung mehr durch. Die seit diesem Zeitpunkt erhobenen Daten beziehen sich daher ausschließlich auf Ergebnisse aus Gesamtgenom-Sequenzierungen.

In der Kalenderwoche 10 (KW10, 06.03.2023-12.03.2023) betrug der mittels Gesamtgenom-Sequenzierung nachgewiesene Prozentsatz der VOC (variant of concern/ besorgniserregenden Variante) Omikron unter 86 Stichproben aus Hamburg 100%. Dabei wurde die Omikron-Untervariante BA.2 in rund 29% aller Fälle nachgewiesen. In weiteren 57% der Proben lag die rekombinante BA.2-Unterlinie XBB.1.5 vor (siehe Tabelle 1). Im Vergleich zum Wert der Vorwoche (48%) ist der Anteil von XBB.1.5 damit erneut gestiegen. Der Anteil von Proben mit der BA.5-Unterlinie BQ.1.1 sank dagegen von 23% in KW9 auf rund 9% in KW10. In einer einzelnen Probe aus KW10 wurde die BA.5-Unterlinie BF.7 nachgewiesen. Die rekombinante BA.2-Unterlinie XBB.1.16 trat in den von uns untersuchten Proben bislang noch nicht auf. Weiterlesen

Abbildung: Entwicklung des prozentualen Anteils verschiedener Abstammungslinien in SARS-CoV-2-positiven Proben aus Hamburg. Die farbig markierten Flächen geben den durch Sequenzierung ermittelten Anteil der rechts aufgeschlüsselten VOCs wieder. Der Anteil der derzeit als unter Beobachtung stehende Varianten (VOIs, variants of interest) eingestuften Abstammungslinien sowie anderer Varianten mit einer oder mehrerer der in Tabelle 2 aufgeführten Fluchtmutationen ist durch die dunkelgrau markierte Fläche wiedergegeben. Die hellgraue Fläche stellt alle anderen Abstammungslinien dar. Die Abbildung beruht auf der Untersuchung von insgesamt 15.939 bis zum Ende der Kalenderwoche 10 gesammelten Proben.

Vorherige Berichte zum Download:

Kontakt LIV:

Prof. Adam Grundhoff (Leitung FG Virus Genomik & TP NGS)

Mail: adam.grundhoff(at)leibniz-liv.de

Tel.: 040/48051-275

Aktuelle Daten der Hamburg Surveillance Plattform

Here you can find current data on the spread of SARS-CoV-2 variants in Hamburg, collected by the Hamburg Surveillance Platform (in German):

10.01.2023: Update der Hamburg Surveillance Plattform HHSurv zur Verbreitung von SARS-CoV-2-Varianten in Hamburg

PDF Download des Berichts vom 10.01.2023

In KW50 wurden die Omikron-Varianten BA.2 und BA.4 in rund 6%, bzw. in rund 1% der Proben nachgewiesen. Die übrigen Proben (rund 93%) waren der Omikron-Variante BA.5 oder ihren Unterlinien zuzurechnen. Die BA.5-Unterlinien BF.7 und BQ.1.1 wurden dabei in insgesamt rund 50% aller Proben nachgewiesen. In KW51 betrug der Anteil von BA.2 rund 8%, BA.4 wurde nicht nachgewiesen. Insgesamt 92% der Proben waren BA.5 oder ihren Unterlinien zuzurechnen, von diesen waren BF.7 und BQ.1.1 für insgesamt rund 56% aller Fälle verantwortlich.

Die Omikron Variante XBB.1.5, welche sich derzeit vor allem in den USA ausbreitet, konnte in den von uns untersuchten Proben aus Hamburg bislang nicht nachgewiesen werden.

Gegenüber den vorangegangenen Wochen nahm der Anteil von Fällen mit der Mutation S:R346T zu und lag in KW51 bei rund 81%. Bei S:R346T handelt es sich um eine Mutation im Spike-(S)-Gen, welche dem Virus ein zumindest teilweises Unterlaufen der Immunantwort ermöglicht (sogenannte Fluchtmutation). Die Mutation war vornehmlich im Hintergrund der BA.5-Unterlinien BF.7 und BQ.1.1 zu finden, sie trat jedoch auch in einigen der übrigen BA.5- und BA.2- sowie allen untersuchten BA.4-Fällen auf. Aufgrund des langfristigen Trends erwarten wir für die kommenden Wochen eine fortgesetzte Ausbreitung der BA.5-Unterlinie BQ.1.1 und/oder BF.7. Weiterlesen

Abbildung: Entwicklung des prozentualen Anteils verschiedener Abstammungslinien in SARS-CoV-2-positiven Proben aus Hamburg. Die farbig markierten Flächen geben den durch Sequenzierung ermittelten Anteil der rechts aufgeschlüsselten VOCs wieder. Der Anteil der derzeit als unter Beobachtung stehende Varianten (VOIs, variants of interest) eingestuften Abstammungslinien sowie anderer Varianten mit einer oder mehrerer der in Tabelle 2 aufgeführten Fluchtmutationen ist durch die dunkelgrau markierte Fläche wiedergegeben. Die hellgraue Fläche stellt alle anderen Abstammungslinien dar. Die Abbildung beruht auf der Untersuchung von insgesamt 15.148 bis zum Ende der Kalenderwoche 51 gesammelten Proben.