
Methoden
Die Expertise der Nachwuchsgruppe, gepaart mit den erstklassigen wissenschaftlichen HPI-Infrastrukturen, bietet die einzigartige Möglichkeit, hochintegrative Technologien anzuwenden, um Arbovirus-Wirt-Interaktionen von einem systembiologischen Standpunkt aus zu untersuchen.
Molekularbiologie & Hochsicherheitslabore
BSL-2-Labore ermöglichen die Arbeit mit genetisch veränderten Organismen auf verschiedenen Ebenen. Zu den Routinearbeiten gehören „Forward“ und Reverse Mutagenese an infektiösen cDNA-Klonen mehrerer Viren, auf Lentiviren basierende genetische Modifikationen menschlicher Zelllinien, Infektionsexperimente mit viralen Pathogenen der BSL-2-Klasse sowie ex vivo-Material.
Darüber hinaus kann in BSL-3+-Laboren sowohl in vitro als auch in vivo mit mehreren hoch pathogenen Arbovirus-Isolaten und molekularen Klonen experimentiert werden.
Massenspektrometrie
Wir haben direkten "hands-on" Zugang zu einer Massenspektrometrie-Plattform der neuesten Generation (timsTOFpro-Analysator, gekoppelt an ein nanoElute-UHPLC-System). Das gibt uns die Möglichkeit, unverfälschte Screening-Profile im großen Maßstab sowie zielgerichtete hypothesengetriebene Experimente durchzuführen. Dazu gehören das Testen von Protein-Protein-Interaktionen, das „Profiling“ der Protein-Expression, die Untersuchung der Proteindynamik sowie posttranslationale Modifikationen.
Zusätzliche Methoden
- Biochemische Assays für Protein-Protein-Interaktion, PTMs und Proteinhäufigkeit
- BRET (Biolumineszenz-Resonanz-Energieübertragung)
- Elektronenmikroskopie (EM) und Korrelative Lichtelektronenmikroskopie (CLEM)
- Fluoreszenzmikroskopie (Spinn- und Raster-Konfokalmikroskopie)
- quantitative Echtzeit-PCR (qRT-PCR)
- Standardmethoden der Molekularbiologie und Biochemie
- Standardmethoden der Virologie
- Mausmodelle zur Untersuchung der Pathogenität (Sicherheitsstufen 2 und 3)