Current data collected by the Hamburg Surveillance

Here you can find current data on the spread of SARS-CoV-2 variants in Hamburg, collected by the Hamburg Surveillance Platform (in German):

04.04.2023: Update der Hamburg Surveillance-Plattform HHSurv zur Verbreitung von SARS-CoV-2-Varianten in Hamburg

PDF Download des Berichts vom 04.04.2023

Die regelmäßige Datenerhebung zu SARS-CoV-2-Varianten durch die HHSurv Surveillance Plattform wird aufgrund der weitreichenden Immunität innerhalb der Bevölkerung zum Ende des ersten Quartals 2023 planmäßig eingestellt. Es handelt sich bei diesem Update daher um den vorläufig letzten Wochenbericht der Plattform.

In der Kalenderwoche 11 (KW11, 13.03.2023-19.03.2023) betrug der mittels Gesamtgenom-Sequenzierung nachgewiesene Prozentsatz der VOC (variant of concern / besorgniserregenden Variante) Omikron unter 37 Stichproben aus Hamburg rund 97%. Dabei wurde die Omikron-Untervariante BA.2 in rund 19% aller Fälle nachgewiesen. In weiteren 27% der Proben lag die rekombinante BA.2-Unterlinie XBB.1.5 vor (siehe Tabelle 1). Im Vergleich zum Wert der Vorwoche (57%) ist der Anteil von XBB.1.5 damit deutlich gefallen. Der Anteil von Proben mit der BA.5-Unterlinie BQ.1.1 stieg dagegen von 9% in KW10 auf rund 43% in KW11. Es kann nicht ausgeschlossen werden, dass die deutliche Veränderung der Prozentzahlen zumindest teilweise auf Randeffekte infolge der relativ geringe Anzahl auswertbarer Proben aus KW11 zurückzuführen ist.

Neben den verschieden Omikron-Varianten wurde in einer Probe XAY.1 nachgewiesen, eine rekombinante Linie aus der Omikron-Unterlinie BA.2 und der zuvor vorherrschenden VOC-Delta. Diese Variante trat bereits in KW1 in den von uns untersuchten Proben auf. Es gibt jedoch derzeit keinerlei Hinweise darauf, dass sie einen Wachstumsvorteil gegenüber den derzeit vorherrschenden Omikron-Varianten besitzen könnte. Weiterlesen

Abbildung: Entwicklung des prozentualen Anteils verschiedener Abstammungslinien in SARS-CoV-2-positiven Proben aus Hamburg. Die farbig markierten Flächen geben den durch Sequenzierung ermittelten Anteil der rechts aufgeschlüsselten VOCs wieder. Der Anteil der derzeit als unter Beobachtung stehende Varianten (VOIs, variants of interest) eingestuften Abstammungslinien sowie anderer Varianten mit einer oder mehrerer der in Tabelle 2 aufgeführten Fluchtmutationen ist durch die dunkelgrau markierte Fläche wiedergegeben. Die hellgraue Fläche stellt alle anderen Abstammungslinien dar. Die Abbildung beruht auf der Untersuchung von insgesamt 15.976 bis zum Ende der Kalenderwoche 11 gesammelten Proben.

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2023

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Prof. Adam Grundhoff (Leitung FG Virus Genomik & TP NGS)

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