Integrative Virologie

Die Abteilung Integrative Virologie unter der Leitung von Prof. Dr. Maya Topf hat sich auf integrative Modellierungsmethoden spezialisiert, die dabei helfen, die Strukturen großer makromolekularer Komplexe, insbesondere von Viren, aufzuklären. Sie analysieren Protein-Protein-Interaktionsnetzwerke, verwenden KI-basierte Ansätze zur Vorhersage und Bewertung von Strukturmodellen und entwerfen Experimente zur Überprüfung der Modelle.

Abteilung Topf 2022Abteilung Topf 2022 © Gisela Köhler
ChemEM-Software © Maya TopfDie ChemEM-Software verwendet CryoEM-Daten für das Andocken von Liganden an Proteinbindungsstellen. Paper im Journal of Medical Chemistry
TEMPy-ReFF Methode © Maya TopfTEMPy-ReFF, eine neue Methode zur Verbesserung atomarer Strukturen in Kryo-EM-Dichtekarten. Paper in Nature Communications

Die Forschungsansätze der Abteilung zielen darauf ab, die Kluft zwischen der molekularen und der zellulären Ebene zu überbrücken, indem experimentelle Daten besser interpretiert werden. Derzeit konzentriert sich ihre Forschung auf Daten aus Kryo-EM, Kryo-ET und Massenspektrometrie und wird auf Herpesviren und Arenaviren angewandt. Ein weiteres Thema sind porenbildende Proteine aus der MACPF-Familie und die Entwicklung von Methoden für das Andocken kleiner Moleküle.

 

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