Molekulare Virologie und Tumorvirologie

Die assoziierte Arbeitsgruppe Molekulare Virologie und Tumorvirologie unter der Leitung von Prof. Dr. Nicole Fischer untersucht die Mechanismen, die zur lebenslangen Persistenz von DNA-Virusinfektionen beitragen. Die Arbeiten der Gruppe konzentrieren sich auf die vergleichende Untersuchung von klinisch relevanten humanen Polyomaviren wie dem BK-Polyomavirus, dem JC-Polyomavirus und dem humanen Tumorvirus Merkelzell-Polyomavirus (MCPyV). Diese Viren können unter Immunsuppression zu schweren Erkrankungen wie Polyomavirus-assoziierter Nephropathie (PVAN und BKPyV), neurodegenerativen Erkrankungen (progressive multifokale Leukoenzephalopathie, PML, und JCPyV) und Hautkrebs (Merkelzellkarzinom, MCC, und MCPyV) führen.

Ziel der Forschung ist es, zelluläre Mechanismen zu identifizieren, die für Infektion, Persistenz oder Pathogenese essentiell sind und einen möglichen Interventionsansatz darstellen können. Zu diesem Zweck arbeitet die Arbeitsgruppe mit primären humanen Zellen und Stammzell-abgeleiteten 3D Organoid-Modellen (Haut- und Nieren-Organoide) für die Anwendung als Infektions- und Pathogenitätsmodelle. 

Neben diesem Schwerpunkt beschäftigt sich die Arbeitsgruppe mit der Anwendung der Hochdurchsatzsequenzierung in klinischen Proben zum Nachweis und zur Identifizierung von Pathogenen. Dieser Forschungsschwerpunkt baut auf einer langjährigen gemeinsamen Infrastruktur zwischen dem UKE und dem LIV (Abteilung Virus Genomik und Technologieplattform Hochdurchsatzsequenzierung) in der Entwicklung und Anwendung von präanalytischen und bioinformatischen Methoden in der Hochdurchsatzsequenzierung zum Erregernachweis auf.