Bioinformatik-Angebot

Die Bioinformatik der Technologieplattform beinhaltet neben Demultiplexing und Qualitätskontrolle der Rohdaten den gesamten Bereich der Sequenzanalyse, weiterführende Downstreamanalysen und Visualisierung der Ergebnisse. Hierfür werden state of the art Algorithmen und Methoden sowie Datenbanken aller Art verwendet. Für die meisten Standardmethoden der Sequenzierung existieren bereits eigens dafür implementierte und etablierte Workflows, welche auch an spezielle Gegebenheiten, wie z.B. virale Interaktion,  angepasst werden können.

• Differentielle Genexpression (mRNA-/RNA-Seq, Microarray)
• (Differentielles) Peak Calling (ChIP-, MeDIP-Seq)
• SNP Calling
• Virale Phylogenetik
• Lokalisation viraler Integrationsstellen
• Differentielle microRNA-Expression und de novo microRNA-Discovery
• Metagenomanalysen
• Copy Number Variants/Alterations
• CRISPR/Cas9
• uvm.

Neben diesen Standards können auch Skripte oder ganze Workflows für gänzlich neue Fragestellungen implementiert werden. Individuelle Beratung, z.B. beim experimentellen Design, sowie langfristige Unterstützung, vom Bereitstellen der Rohdaten bis zum Upload dieser bei einer der INSDC-Datenbanken, gewährleisten beste Resultate.