Geräteinformation

Die Technologieplattform Hochdurchsatz-Sequenzierung ist mit Sequenzier-Geräten der Firmen Illumina und Oxford Nanopore ausgestattet. 

Details zur Sequenzierung durch Synthese-Technologie der Firma Illumina sind auf den Internetseiten der Firma zu finden.  

Folgende Geräte sind verfügbar: 

MiSeq  

Auf dem MiSeq können Sequenzierungen mit geringem Durchsatz durchgeführt werden, beispielsweise können hiermit Virus- oder Bakteriengenome sequenziert werden. Darüber hinaus ist der MiSeq das Gerät der Wahl für die Sequenzierung von Amplikons.  

Je nach Anwendung stehen verschiedene Optionen bezüglich Leselängen und Menge an generierten Daten zur Verfügung. Eine detaillierte Auflistung dieser MiSeq-Spezifikationen finden Sie hier. 

NextSeq  

Der NextSeq 500 ist für Sequenzierungen mit mittlerem Durchsatz geeignet. Er wird beispielsweise für RNA- und ChIP-Sequenzierungen verwendet, kann aber auch ein komplettes Humangenom pro Lauf sequenzieren. Je nach Anwendung stehen verschiedene Optionen bezüglich Leselängen und Menge an generierten Daten zur Verfügung. Information zu Laufoptionen auf dem NextSeq finden Sie hier. 

MinION  

Neben den Illumina-Geräten verfügt die Technologieplattform über MinION Geräte der Firma Oxford Nanopore. Der MinION ist ein Sequenzier-Gerät der 3. Generation und bietet die Möglichkeit, sehr lange Leselängen (mehrere hundert kb) zu erzielen - allerdings bei relativ geringem Durchsatz im Vergleich zu den Illumina Geräten. Genauere Informationen zum MinION finden Sie auf der Internetseite der Firma Oxford Nanopore.    

Bioinformatische Infrastruktur  

Die Technologieplattform ist ausgestattet mit Hochleistungs-Rack-Servern zur Datenanalyse sowie NAS-Servern zur redundanten Datenspeicherung,  Archivierung  und zum Datenaustausch mit externen Benutzern.