Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE)

Seit 2011 besteht eine strategische Partnerschaft zwischen der LIV-Forschungsgruppe Virus Genomik und dem Institut für Medizinische Mikrobiologie, Virologie und Hygiene des UKE. Integraler Bestandteil dieser Partnerschaft ist die Technologieplattform Hochdurchsatz-Sequenzierung des LIV, welche Techniken zur metagenomischen Analyse von Infektionserregern in klinischen Proben zur Verfügung stellt. Im Rahmen der Partnerschaft wurde beispielsweise die von der Freien und Hansestadt Hamburg geförderte Surveillance von Virus-Varianten während der SARS-CoV-2 Pandemie durchgeführt, darüber hinaus werden mit Unterstützung des DZIF neue Verfahren zum Identifikation pathogener Erreger entwickelt. Weiterer Gegenstand der Partnerschaft zwischen UKE und der Forschungsgruppe Virus Genomik ist die Untersuchung chronischer DNA Viren, sowohl innerhalb gemeinsamer DZIF Projekte, wie auch im Rahmen der DFG-geförderten Forschungsgruppe FOR 5200.

Enge Zusammenarbeit bestehen zwischen dem LIV und dem UKE zudem bei Studien zur Pathogenese der HIV-1 Infektion. Die Abteilung Virus Immunologie untersucht gemeinsam mit Kolleginnen und Kollegen am UKE, sowie afrikanischen Kolleginnen und Kollegen in Südafrika, Simbabwe, Kenia und Kamerun die metabolischen Determinanten der HIV-1 Erkrankung im Rahmen eines internationalen Netzwerkes, das durch die DFG gefördert wird. Zudem ist die Abteilung Virus Immunologie an Untersuchungen der DFG-geförderten Forschungsgruppe RU 5068 zu geschlechterspezifischen Unterschieden in Immunantworten beteiligt. Prof. Altfeld ist Sprecher der TTU HIV im DZIF, und koordiniert die HIV-1 Forschungsprojekte zwischen dem LIV und dem UKE.

Eine weitere klinische Kooperationsgruppe arbeitet mit der Abteilung Virale Zoonosen - One Health zusammen: In die Abteilung ist eine klinische Kooperationsgruppe aus dem UKE unter der Leitung von Frau Prof. Petra Arck integriert. Gemeinsam untersuchen sie, weshalb bestimmte Risikogruppen im Vergleich zu anderen besonders gefährdet sind, an einer schweren Influenza zu erkranken oder gar zu versterben.

Die Abteilung Virus-Wirt-Interaktion pflegt eine langjährige Kooperation mit der Arbeitsgruppe von Prof. Felix Stahl, Institut für Immunologie, UKE. Gemeinsam werden Untersuchungen am Maus-Modell der konnatalen CMV-Infektion durchgeführt. Diese Studien waren in die Klinische Forschungsgruppe KFO296 „Feto-Maternal Immune Cross Talk“ (Sprecherin: Prof. Petra Arck, UKE) eingebunden und sind Bestandteil einer aktuellen SFB-Initiative.

Die BMBF-Nachwuchsgruppe Genomik Retroviraler Infektionen hat, gefördert durch die Erich und Gertrud Roggenbuck-Stiftung, eine Zusammenarbeit mit dem UKE Institut für Neuropathologie begonnen. Gemeinsam sollen neuartige Biomarker für bestimmte pädiatrische Hirntumore gefunden werden.